Η Σκύρος έχει τακτική απευθείας αεροπορική σύνδεση με Αθήνα και Θεσσαλονίκη, επιπλέον τους θερινούς μήνες συνδέεται με πολλές Ευρωπαϊκές πρωτεύουσες μέσω πτήσεων charter.